Depuis 2005, l’ENSEA et l’Institut Nationale de Statistique et de Démographie (INSD) du Burkina Faso ont convenu d’entreprendre une coopération mutuelle visant à soutenir la formation des techniciens de la statistique compétents pour l’Appareil Statistique burkinabé dans un Centre de Formation domicilié à Ouagadougou.

Ce partenariat s’est concrétisé en 2005 par l’ouverture d’une Division Statistique de l’Ecole Nationale. Des Régies Financières (ENAREF) formant des Agents et Adjoints techniques de la statistique.

Dans le cadre de ce partenariat, l’ENSEA participe à l’organisation des concours d’entrée en proposant et corrigeant les épreuves et en organisant le jury d’entrée. L’ENSEA appuie également la coordination pédagogique et mène des missions d’enseignement. Enfin, l’ENSEA participe au jury de fin d’année et délivre les diplômes.